MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 6757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017846	AATA	2	8	21	28	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017846	T	6	6	53	58	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017846	GAT	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017846	ATT	2	6	1096	1101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017846	T	6	6	1131	1136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017846	TAT	2	6	1151	1156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017846	ATTG	2	8	1205	1212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017846	CTTA	2	8	1274	1281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017846	GGT	2	6	1306	1311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017846	AAT	2	6	1318	1323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017846	TAT	2	6	1334	1339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017846	TTC	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017846	T	7	7	3699	3705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017846	ATT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017846	GTC	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017846	GGA	2	6	3831	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017846	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017846	A	6	6	4984	4989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017846	T	6	6	5009	5014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017846	T	6	6	5042	5047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017846	CGG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017846	A	7	7	5067	5073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017846	ATG	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017846	TAAA	2	8	6681	6688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017846	TTA	2	6	6689	6694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017846	ATT	2	6	6707	6712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017846	GAA	2	6	6786	6791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017846	GATT	2	8	6874	6881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017846	ATCT	2	8	7988	7995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017846	T	6	6	8772	8777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017846	CAA	2	6	8787	8792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017846	A	6	6	8791	8796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017846	AG	3	6	8801	8806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017846	C	7	7	8811	8817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_017846	T	7	7	8823	8829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017846	TTTG	2	8	10425	10432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017846	GAA	2	6	10434	10439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017846	ATTT	2	8	11430	11437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017846	TAT	2	6	11456	11461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017846	T	6	6	11469	11474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017846	ATT	2	6	11475	11480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017846	T	7	7	11498	11504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017846	ATG	2	6	11513	11518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017846	A	6	6	11532	11537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017846	A	6	6	11619	11624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017846	T	7	7	11627	11633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017846	GA	3	6	14229	14234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017846	GAAT	2	8	15262	15269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017846	AG	3	6	16370	16375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017846	T	6	6	17274	17279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017846	T	6	6	17636	17641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017846	CA	3	6	17645	17650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017846	A	6	6	17650	17655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017846	T	6	6	17676	17681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017846	CGTTA	2	10	17692	17701	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017846	TACA	2	8	19112	19119	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017846	TTC	2	6	19127	19132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017846	TCT	2	6	19137	19142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017846	TTGTA	2	10	19169	19178	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017846	CAA	2	6	19206	19211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017846	TAT	2	6	19233	19238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017846	A	6	6	19345	19350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017846	A	6	6	19359	19364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017846	GT	3	6	20427	20432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017846	CG	3	6	20461	20466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017846	ATC	2	6	20469	20474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017846	TGT	2	6	20480	20485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017846	GGT	2	6	20494	20499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017846	T	6	6	20499	20504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017846	TGA	2	6	22257	22262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017846	GTG	2	6	22291	22296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017846	AAAAAT	2	12	22297	22308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017846	ACA	2	6	22313	22318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017846	AG	3	6	22368	22373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017846	AT	3	6	25458	25463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017846	TAT	2	6	25473	25478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017846	ATA	2	6	25494	25499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017846	CTT	2	6	25541	25546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017846	GTT	2	6	25548	25553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017846	ATCAA	2	10	25557	25566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017846	TCG	2	6	25603	25608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017846	T	6	6	25618	25623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017846	TGA	2	6	25672	25677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017846	ACCT	2	8	25710	25717	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017846	A	7	7	25766	25772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017846	GAA	2	6	25773	25778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017846	A	6	6	25804	25809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017846	AAC	2	6	25859	25864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017846	TTTTG	2	10	28379	28388	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017846	TTG	2	6	28390	28395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017846	GT	3	6	28407	28412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017846	A	6	6	28423	28428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017846	GGTG	2	8	28433	28440	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017846	CAATT	2	10	28514	28523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017846	AGA	2	6	28634	28639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017846	TGG	2	6	28652	28657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017846	GAAA	2	8	28696	28703	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017846	CGGT	2	8	28752	28759	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017846	GGT	2	6	32287	32292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017846	T	6	6	32292	32297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017846	AT	4	8	32347	32354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017846	A	6	6	32365	32370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017846	CAG	2	6	32394	32399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017846	G	7	7	32399	32405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017846	AT	3	6	32434	32439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017846	TAA	2	6	32440	32445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017846	A	6	6	32444	32449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017846	ATG	2	6	32490	32495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017846	TA	3	6	32528	32533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017846	TC	3	6	32573	32578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017846	TAT	2	6	33144	33149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017846	AACC	2	8	33174	33181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017846	ATTC	2	8	33474	33481	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017846	TAA	2	6	33742	33747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017846	AT	3	6	33858	33863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017846	CAG	2	6	33878	33883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017846	TAT	2	6	33911	33916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017846	TG	3	6	35349	35354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017846	T	6	6	35646	35651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017846	AGG	2	6	36007	36012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017846	CCT	2	6	36018	36023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017846	AAAT	2	8	39677	39684	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017846	T	6	6	39807	39812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017846	TTA	2	6	41322	41327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017846	GTTT	2	8	41344	41351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017846	T	6	6	41360	41365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017846	GC	3	6	41431	41436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017846	GGA	2	6	41513	41518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017846	G	6	6	41558	41563	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017846	GCA	2	6	41582	41587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017846	CCG	2	6	41597	41602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017846	GCC	2	6	41656	41661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017846	GCA	2	6	41673	41678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017846	AATG	2	8	41717	41724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017846	ATGA	2	8	41779	41786	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017846	A	6	6	41835	41840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017846	T	6	6	41862	41867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017846	ATT	3	9	41964	41972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017846	T	7	7	42914	42920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017846	A	6	6	42986	42991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017846	T	7	7	42996	43002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017846	GAA	2	6	43036	43041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017846	GA	3	6	43044	43049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017846	T	6	6	43066	43071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017846	T	6	6	43078	43083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017846	AAT	2	6	43107	43112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017846	T	7	7	43173	43179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017846	TGAG	2	8	44202	44209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017846	GAT	2	6	46952	46957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017846	TGT	2	6	46990	46995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017846	GCC	2	6	47011	47016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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